「番茄紅了，醫生的臉就綠了！」是台灣民眾耳熟能詳的廣告台詞，側面描述了番茄的豐富營養價值。千禧之愛健康基金會營養顧問高繪雯營養師表示，番茄的營養素繁多，而在這些營養素中，又以「茄紅素」、「維生素Ｃ」、「膳食纖維」最為重要。除了上述營養素外，番茄還有豐富的鉀、維生素A、GABA及硼、錳、銅微量元素與榖胱甘肽。
大番茄當蔬菜，小番茄當水果，3類民眾多留意番茄攝取
根據衛福部食藥署的食品營養成分資料庫（新版）及營養師呂孟凡的資料，每100g的紅色系大番茄，就含有14.0mg維生素Ｃ、1.0g的膳食纖維、1692I.U.的維生素A、217mg的鉀，2573ug的茄紅素而熱量僅有19大卡。
| 紅色系大番茄（100g） | 紅色系小番茄（100g） | |
| 熱量 | 19kcal | 33kcal |
| 水分 | 94.5g | 90.9g |
| 維生素A | 1692 I.U. | 11626 I.U. |
| β-胡蘿蔔素 | 1015ug | 6979ug |
| 維生素E | 0.69mg | 0.93mg |
| 維生素C | 14mg | 43.5mg |
| 鉀 | 217mg | 269mg |
營養師高繪雯表示，儘管大、小番茄營養都很豐富，營養成分上還是略有差異。大番茄含水量較高、含糖量較低，因此屬於「蔬菜類」；小番茄則被分為「水果類」，參考國人每日飲食指南一天食用2份即可。
不過，有幾類型的民眾不能大啖番茄。首先，番茄對部分的人來說可能容易引起過敏，美國歌手亞莉安娜（Ariana Grande）就曾因為吃番茄過敏導致喉嚨痛、無法唱歌而取消演唱會，因此若有過敏體質的人，需多加注意自己是否會對蕃茄過敏。
其次，番茄具有高濃度的鉀，營養師高繪雯建議，患有慢性腎臟病及接受洗腎治療的患者，一定要減少食用量，或先將番茄汆燙去除鉀離子後再食用。
此外，番茄的性質在中醫看來較偏寒涼，因此彭溫雅中醫師也曾撰文提醒，腸胃寒涼者不宜多吃。
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