另一方面，由於人體吸收維生素B12與胃、胰臟、小腸有關，一旦消化吸收過程中任一環節出問題，也可能造成吸收不良。近年因長期吃胃藥造成胃酸分泌不足，進而導致缺乏維生素B12的案例也時有所聞。其他可能影響因素包括：
- 胃萎縮或動過切胃手術
- 罹患自體免疫疾病
- 因腸道疾病、乳糜瀉而長期腹瀉、腸黏膜受損
- 寄生蟲感染
- 胰臟功能缺失
- 愛滋病
- 長期吃糖尿病用藥
衛生福利部花蓮醫院檢驗科鄭惠雯主任則提醒，一般民眾隨著年紀漸長，維生素B12的吸收率也會下降，因此有消化道狀況而影響營養吸收的患者、中高齡族群都須多加留意。
全素者也可從藻類、海苔、天貝、植物肉等素食食品補充
若有維生素B12不足的問題，就診後民眾可多和醫師討論，是否需透過補充劑等藥品、保健食品補充並治療。
若想透過食物補充，由於富含維生素B12的食物多為動物性食品，一般民眾可透過肉類、肝臟、海鮮等食材攝取。若是素食者，營養師陳怡婷則建議，可透過藻類、海苔、營養酵母、天貝來補充；蛋奶素者則可以選擇蛋、乳品類補充。
美國營養師Brenda Davis則曾在《全植物飲食．營養全書》中指出，部分素食者能食用的麥片、穀物棒、植物奶、植物肉（未來肉）會特別強化維生素B12的含量，素食者在挑選素食產品時，不妨可多加留意營養標示。
參考資料:
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