免疫系統
。腸道的健康，繫於腸道中維持菌叢生態平衡的平衡，而其關鍵就在於對人體有益的菌屬（即我們所說的益生菌）數量是否足夠。
除了腸道健康，益生菌對人體還有哪些好處
現在許多人已經知道用益生菌來促進腸道健康，減少腹瀉或便秘，而對於益生菌與氣喘、過敏及各種免疫疾病之間的關聯性，也有了更多的了解。但是益生菌的功效遠不止於此。以下是近年與益生菌相關的醫學研究，讓我們對這些非常微小的生物，在人體健康上所扮演的角色，有著一番新的體認。
一、代謝症候群與糖尿病
無論在動物實驗或是人體的臨床研究都發現，益生菌可以改善胰島素阻抗的現象，使得代謝症候群及糖尿病獲得比較好的控制。其中一個2012年的研究證實，經過六週的補充，第二型糖尿病病患的空腹血糖以及糖化血色素（HbA1C），都有大幅的降低。
二、改善血脂及心血管疾病
許多研究發現，補充益生菌可以降低血液中的總膽固醇以及壞的低密度膽固醇，而更難能可貴的，竟然還可以提升好的、保護性的高密度膽固醇。在此同時，益生菌還可以減少脂肪組織（譬如腹部）的發炎狀況，使得血管中發炎性的膽固醇斑塊的形成減少，讓動脈硬化的機率降低。
三、預防癌症
益生菌可以藉由抑制一些會產生致癌物的壞菌、粘附在致癌物上促使排出、刺激肝臟的排毒機能，以及降低發炎反應這些手段，來預防癌症，尤其是大、直腸癌的發生。
四、預防流感與感冒
平時補充益生菌，尤其在感冒或流感流行期的前三到六個月就開始補充，一旦感染，症狀平均可以減少1到2天（甚至更多天），而嚴重性也會大大降低。這對雖然注射了疫苗，但保護率只有約六成的老年人來說，尤其重要。