不適合蛋白質補充品1：腎臟疾病患者
儘管消化吸收很重要，但「代謝排出」卻經常被人忽略，而在人體中負責將蛋白質代謝物排出體外的器官就是腎臟。當吃太多蛋白質，容易導致腎臟內的球型微血管網「絲球體」的壓力增加，對於健康的人不會有太大的問題，但若是本身就患有腎臟疾病，就可能導致絲球體損傷，讓原本的症狀更加嚴重，因此應該盡量避免攝取高蛋白等補充品。
不適合蛋白質補充品2：結石患者
不論是已經患有腎臟結石患者，或者是有家族病史、過去曾有過病史的民眾，甚至是尿道容易反覆發炎的情況，都應該避免使用蛋白質補充品。「當吃下太多蛋白質，腎臟為了去除分解代謝後的產物，就需要大量的水分。」鄭醫師解釋，如果沒有補充足量的水分，就容易出現脫水，同時還會產生許多濃縮的沈殿物，增加結石的風險。
因此，上述的民眾比起濃縮蛋白質產品，會更建議藉由食物來獲得蛋白質，同時還要隨時注意補充水份。此外，因為需要大量水份，加上消化時間較長，如果是本身患有便秘的患者，也會建議盡量避免。
不適合蛋白質補充品3：肝臟疾病患者
在蛋白質的代謝過程中會產生「氨」，這種有毒物質必須透過肝臟分解成尿酸，才能夠被腎臟處理、排出。如果是肝臟機能已經出現狀況，又吃下大量的濃縮蛋白質，就會導致氨無法被正常代謝，引發昏睡、造成生命危險。尤其是慢性肝臟疾病或是肝硬化等疾病，更可能會因此惡化，所以必須要特別注意。
那痛風呢？鄭醫師表示，引發痛風的尿酸和高蛋白等營養品並沒有直接相關，反而是健身人士常吃的雞胸肉中含有普林，會更容易引發痛風的症狀。儘管如此，她還是建議痛風患者或有病史的民眾，還是盡量應該避免，否則為了代謝蛋白質，腎臟處理尿酸的能力還是會受到影響。
不適合蛋白質補充品4：糖尿病患者
依照不同型態的糖尿病，蛋白質對身體的影響也會有所差異。以第二型糖尿病而言，飯前攝取分離乳清蛋白質，能夠增加碳水化合物的消化吸收時間，同時還可以提供飽足感、幫助控制血糖與食量，因此只需要注意產品是否添加額外的糖分即可。但如果是因為糖尿病導致腎臟已經出問題的患者，就如同腎臟疾病患者，應該要少碰為妙。
不適合蛋白質補充品5：對牛奶過敏
由於蛋白質產品中最常使用的「乳清蛋白質」就是來自牛奶，如果本身就對牛奶過敏，也有很大的機率會對乳清蛋白質過敏。和乳糖不耐症只是無法消化乳糖相比，對牛奶過敏的民眾喝下牛奶後，會觸發免疫反應，造成皮膚乾燥、皮膚癢、腸胃炎、便秘等發炎反應，這樣的狀況也比較常發生在本身體質比較燥熱的人身上。
不適合蛋白質補充品6：長痘痘
在營養品中，蛋白質補充品是容易引發痘痘的品項，因為其中來自乳清蛋白質的賀爾蒙IGF-1，雖然能夠幫助強化肌肉，但同時也會增加睪固酮濃度，進而引發痘痘。儘管不是每個人都會因此長痘痘，但已經很嚴重，或者是血中IGF-1濃度偏高的民眾或青少年，都應該特別注意。
不適合蛋白質補充品7：雄性禿
乳清蛋白質會增加血中睾固酮濃度，而雄性禿正是因為睪固酮過量、刺激毛囊萎縮導致。因此，如果本身已經是雄性禿，則應該盡量避免，否則容易導致症狀加劇。
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