2. 明年台灣BNT數量暫時不明
雖然今年度在鴻海永齡、台積電及慈濟等企業與民間團體的幫助下，BNT疫苗逐漸到貨，但以目前指揮中心公布的採購案來說，BNT疫苗的購買數量仍不明朗。此時混打了BNT疫苗，若明年度沒有要買BNT疫苗，又或買的數量不多，那麼AZ混打BNT疫苗的第三劑該接種什麼疫苗將是個問題。
這是因為，混打疫苗事實上是有順序的，為了避免混打疫苗後產生「血栓併血小板低下症候群」（VITT）的風險，以及避免人體對某些特定抗原產生免疫反應的可能，根據加拿大的疫苗接種指南的建議，混打第一劑施打以腺病毒為載體製成的疫苗（如AZ疫苗），而第二劑則可以選擇以mRNA技術製成的疫苗（如BNT疫苗、莫德納疫苗）。
混打的副作用可能較大
除了上述的兩個思考角度外，民眾也應注意，混打不同疫苗，將等於承受兩種疫苗不同的風險。林口長庚副院長邱政洵也曾受訪指出，國外已有一些混打的研究，發現混打的副作用（如發燒、疼痛、腫痛、疲倦、疲累等）都會比第一劑只打 AZ 的明顯。
不見得混打最好，若爽約AZ第二劑，將停1期才能再預約
前台大感染科醫師林氏璧也於臉書發表AZ混打BNT疫苗的意見，表示「新冠疫苗很可能不是打完兩劑就結束的事情」，建議民眾不需要挑疫苗，因為現在覺得最好的組合，半年後回頭看不一定如此。
台灣兒童感染症醫學會理事長邱南昌則受訪指出，雖然研究看起來抗體濃度較高，但不用混打效果疫苗保護效果也很好，因此一般民眾不見得都要混打。
若民眾已經決定採用AZ混打BNT疫苗的策略，並且決定將放棄AZ疫苗的第二劑預約，想等第13期的混打開放，莊人祥提醒，針對第12期AZ第二劑已預約但未接種的民眾，系統會設定跳過1期，也就是說，最快要等到第14期才有預約資格。不過，若是第12期本來就沒有預約的民眾，待13期開放混打，即有預約資格。
參考資料:
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