膿瘍的原理是這樣的。
肛門周邊有許多腺體，開口在肛門內。這些在人體已經退化得差不多了；但在臭鼬或貓狗身上，卻仍有活躍的分泌功能。
腺體退化了，卻還是存在，偶爾免疫力差時，細菌或殘渣堵塞肛門內的腺體開口，便引起了肛門邊腫脹成一個大膿包；白話來說，就像是肛門旁長了個很大的痘痘，只是引起這個大痘痘的菌種從腸道來，比平常皮膚表面來的細菌棘手，也比較壞。
痘痘發生時的基本處理就是，先擦抗生素藥膏、服用抗菌製劑，觀察看看是自己會消、還是自己會熟，熟成的痘痘可能會破了出些膿水；肛門膿瘍的照護概念也近似這樣，但不同的是，肛門質地較鬆軟，膿包有時會快速擴散、或往四面八方竄，所以，維持警覺，及時就醫是重要的。
肛門膿瘍慢性發炎：50%形成肛門瘻管
膿瘍發生跟免疫力較差相關，所以膿包很容易亂竄、也可能捲土重來，有時候病人清創後，有一半左右的機會可能會形成慢性發炎的一小段管道--也就是瘻管。
白話說來，瘻管像是個潛藏的地下髒水溝，所以一旦形成瘻管，肛門旁痛、腫等不適症狀可能會一而再、再而三來襲，久而久之，受刺激的瘻管內組織可能因為慢性發炎而病變，所以不能丟著不管它；手術的目的是把髒水溝找出來，把水溝蓋掀開，把裏頭潛藏的細菌、化膿的腺體殘骸（水溝裡的汙泥）清乾淨，然後讓健康的組織從底層長上來。
這個術式後很可能需要住院換藥，換個幾輪，以優碘紗布吸附殘留的髒污、或優碘坐浴，等待慢性發炎的爛肉屑排出。有時門診病人會很慌張地問我：是不是會切斷肌肉……網路上寫得好恐怖我不要開刀，其實清創後，多半會比膿水脹痛的感覺舒服很多，一般人有著正常免疫力之下，膿包無限擴張或往深層鑽的機率也沒那麼高，但到底實際情況如何，還是需要在門診，由醫師替您做專業的臨床判斷。
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