治療方面，針對輕度患者，會使用抗發炎藥物治療，降低發炎對腸道造成的破壞，而重度患者，則會使用針劑類固醇合併抗發炎藥物或免疫調節劑，若仍然無效，就須透過生物製劑治療，以協助修復腸黏膜，降低未來癌化的風險。
張家熙提醒，患者平時應避免過於刺激、油膩或引起脹氣的食物，多補充鐵質、葉酸改善貧血症狀，富含蛋白質的食物有助腸黏膜修復，同時切記症狀改善也不可擅自停藥，需長期回診追蹤，才能改善生活品質，並減少併發症。
※潰瘍性結腸炎與大腸激躁症比較
| 潰瘍性結腸炎 | 大腸激躁症 | |
| 症狀 | 慢性腹痛、腹瀉、血便、發燒、體重減輕、食慾下降、貧血 | 慢性腹痛、脹氣、腹瀉、便秘（或腹瀉與便祕交替出現），壓力下症狀加劇 |
| 好發族群 | 20歲左右年輕人、50-60歲中年人，男女皆有 | 各年齡層都有，以女性居多 |
| 發生原因 | 發生原因不明 | 與緊張、壓力大相關 |
| 發生位置 | 常發生於直腸、大腸 | 無 |
| 大腸鏡檢查結果 | 可見腸道發炎甚至潰瘍 | 檢查正常 |
| 治療方式 | 輕度患者使用抗發炎藥物，重度患者使用針劑類固醇合併抗發炎藥物或免疫調節劑，若均無效，則以生物製劑治療 | 用解攣劑緩解腹瀉，或軟便劑減輕便秘 |
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