偏頭痛有四種次類型：
1.
無預兆偏頭痛（Migraine without aura）
這是最常見的；2.
預兆偏頭痛（Migraine with aura）
，會同時或先出現在神經學上統稱為「預兆」（aura）的症狀，持續數分鐘至一小時。視覺不適是最普遍的預兆，還可能有光線、點或線的「閃爍」（scintillations）以及「盲點」（scotoma），也就是突然看不見部分或整體視野。其他預兆還包括身體或臉部單邊感覺麻痺、語言障礙。預兆症狀雖然能夠恢復，但因為太不尋常，在診斷之前都不免令人煩憂。此外，偏頭痛在發作前會有長達二至四十八小時的「前驅症狀」（premonitory symptoms），又可稱為「前驅期」（prodromephase）；其症狀包括頸部僵硬、對光線、聲音和氣味敏感、疲累、亢奮、抑鬱、不尋常的飢餓感、對特定食物的渴望、打呵欠和臉色蒼白。
這些症狀也可能在偏頭痛後期或恢復期間變明顯。雖然是「後期」（postdrome），但這部分未被納入 ICHD-3 beta 版本內，許多患者回報在偏頭痛後有這明顯的階段。這階段可能持續六至二十四小時，出現和其他階段一樣的非頭痛症狀，包括最常見的疲累和頸部疼痛，以及對光線、聲音和氣味的敏感、暈眩和沒有胃口。
另外兩種次類型，3.
生理期偏頭痛（menstrual migraine）
，即在生理期前或剛開始時發生；4.生理期相關偏頭痛（menstrualrelated migraine）
，指的是同一個月出現經期偏頭痛症狀外，其他時間也有類似症狀。偏頭痛患者會想找個可以遠離所有刺激元的安靜環境。他們不僅對光線、氣味、聲音和肢體接觸敏感，也可能會有視覺障礙和情緒轉換問題。就算是小小的動作也會讓他們有諸如噁心、嘔吐的症狀，和頭痛一樣折磨人。若此類頭痛發作時還伴隨其他因素，像是肌肉緊繃或藥物使用過度，就可能持續數週或數月，變成長期病症。
叢發性頭痛（Cluster headache）
叢發性頭痛是好發於男性，感受最疼且最罕見的原發性頭痛。顧名思義就是在密集時間內多次發作。每次發作可能持續數週或數月，消失一段時間又出現。疼痛時間可能是十五鐘至八小時，一天最多會有八次，但也有人是隔日發作一次。此類患者通常會在每年的同個季節或同個月分發作，所以也有一說指叢發性頭痛與生物節律（circadian rhythms）有關。李．庫卓醫學博士主持的臨床研究證實了氧氣療法的積極成果，讓我聯想到呼吸練習可能有舒緩作用。
叢發性頭痛的獨特症狀與其他偏頭痛的情形完全不同，患者會有一隻眼睛出現尖銳的刺痛，同側鼻孔會流鼻水；此外患者會感到焦慮，不安地來回踱步，甚至會想用頭撞牆舒緩症狀（偏頭痛患者則是躺在陰暗的房間內，靜靜待著不動）。叢發性頭痛的疼痛痛苦難耐，甚至還曾出現自殺案例，因此這類頭痛也有「自殺性頭痛」之稱。其他類型的頭痛若非常劇烈，儘管症狀或許完全不同，也可能會被誤診為叢發性頭痛。
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